Hv.K.K.lığının lojistik icra faaliyetlerinin yönetim merkezi olan Hava Lojistik Komutanlığı Karargahı Ankara’da konuşlanmıştır. Karargah faaliyetleri Kurmay Başkanına bağlı Başkanlık, Daire Başkanlıkları tarafından yürütülmektedir.

Hava Lojistik Komutanığının bağlı birlik komutanlıkları;

• 11'inci Hava Ulaştırma Ana Üs Komutanlığı (Etimesgut/ Ankara),
• 12'nci Hava Ulaştırma Ana Üs Komutanlığı (Kayseri),
• Hava Malzeme Transit Komutanlığı (Haydarpaşa/ İstanbul)’ dır.